Иоанну тоже пришлось защитить Никею от крестоносцев. Их привели братья почившего Феодора, тоже претендовавшие на престол. Разбив конкурентов весной 1224 года при Пиманионе, император начал перестройку.
Византийская экономика прежних времен не блистала инновационнностью: правящая династия, аристократия и духовенство добывали средства эксплуатацией крестьян, ремесленников и купцов. Небольшая Никейская империя себе такого позволить не могла: возмущенный поборами житель мог уехать в Трапезунд, Эпир или Константинополь. Править пустыми землями Иоанн не хотел, зато желал усиления личной власти. Создать противовес аристократии, уменьшив влияние знати на государственные дела, мог бизнес.
Политику Иоанна Дука Ватаца чуть позже назвали бы протекционизмом. В своих поместьях Иоанн установил особые правила: невысокие налоги способствовали накоплению средств у крестьян, одновременно правитель стимулировал приобретение новых средств производства. Руководили хозяйствами не аристократы, а эффективные менеджеры из простонародья. Вскоре в императорских владениях начался резкий рост урожаев, поголовья скота, площадей виноградников.
Одним из показателей экономических побед Иоанна стала роскошная золотая корона его супруги Ирины, купленная исключительно на прибыль от продажи яиц с передовых императорских курятников. Видя успехи сюзерена, ему стали подражать вассалы.
Над «яичной короной» можно было смеяться, но смеяться над бурно растущей мощью Никейской империи соседям оставалось недолго.